Names & Information

Knowledge of BnaC09T0488400ZS:

Gene Name
BnaC09T0488400ZS
Gene Location
Gene Structure
Protein Name
Alternative splicing
-
Homology
Best Hit (NR)
Best Hit (SwissProt)
NT seq
Len:1779 nt

ATGGCCTCGGCGATTGTTCCGTCGCTCAGGCTGAGTCCCAGTTTATCCGACGCCACGTCACCATCGTCTCCCTCTTCCTC
CGGCGACGATTTAGGGGCAATTCAGGAGACTACAGGAAGCTGGAGTACGGAAACGCTGATATCTCCTTTGTTGTTCACAC
TGGACCACCACCCAGAGGGCTATCATGGGTTGATCAAACAAGAGGTCTTCTCCATTACGTCGAAGAGCACTGTGCAAAAA
CTGTTTACACTCCTTGAGCTGTATTGCCGGGAGTCTATAGGTAGATACATTCGTGGAGCTCCTTTAGTGGACAAGGCAGA
TGCAAATCTTGATTCTGATGAATCGATCTCAGCGCTTACTATAGCATTGGTTTCTTCAGGGCCTAGTTTGCGTGCTCGTT
TTGTAGGGCAAGGATATAAGCATGTTTGTGGAAGAGCTGACATGTGGTACCTGAGGTTTCAGCTCATCTTGAAGGTGCAC
TTAATCTTAGCTTCAACGGTTGACAAGAAGAAGGTGAAGAAATGGAAAGAAGCTTTGACGATACTAGCTGCTATTTCTGG
TGAAGATTCTCGGAATTGGAGGGATGAGTCAAAGCTGATTAAGAAGATCGTTAAAGACATTTCTGATAAACTGGTTTTCA
CTTCATTGGATGATTCAAAAGGGTTGATTGGAATGAGTTCCCATATGGACTTTCTGCAGTCTATGATGTCTATAGAGGAC
GAAGATGTTCGAATGGTAGGGATTTGGGGAATGGGTGGAGTTGGGAAAACTACGATTGCTAAATACTTATACAGTGGACT
CTCATGTCGATTCCAAGCTCATTGCTTCATAGAGAATGTGAAGGAAGTCTATAACAGATATGGAGTTAGGCATTTTACAA
GGAGAGTTTCTATGCAGAATGTTTGGAGAGCTTTCGAGGGATTGTCTAATCTCAAGCTTCTCAACTTCTATGACCTTGCA
TATAACGGAGAGACCAGAATGCATCTACCTGATGGCCTAAGTTATCTCCCACGCAAGCTTCGTTCTCTACACTGGGATGG
ATACCCTTTAAAGTCTATGCCTTCAAGATTTCATCCGGAGTTTCTTGTTGAATTTTGTATGAGTAATAGCCATCTCCAAA
AACTTTGGAACGGAGTCCAGAGCTTTCCACCAGAAATATGCCAGACAATGAGATGCTTGAGGTGGCTTGATTTAGAAGGG
ACCGGTATTAAAGAACTGCCTGAAAACAATGGTAATTTGATAGCCCTCAAGGTGCTTCAAGCTAGAAGAACAGCGATAAG
ACGAGCACCACGGTCAATTGCGCTACTTACCCGTCTTCAAGTTTTAGCAATTGGGGATAGCTTCTATGTTTCAGAAGGTT
TACATTCTCTATGTCCTCGCTTATCAAGTTTTGATGACTTGAGAGTTCTGTGTCTAAGCAACATGAACATGACAGAGATT
CCTAACAGTATTGGTGACTTATGGAGTCTATCAGAACTTGATTTGAGTGCGAGCAACTGTTACAAACTGGATCAAGAGGC
ACAGAGTCTCATTCACCGTAACGTGCAGCTAGACTCAGCAAGACCAGAACACTTGTACTTTCCTGGAAGAGATGTGCCAT
CTTGCTTCAGTCACCAAACCATGGGACCTTCGCTAAGAATACACGTGCCTCAGAGTCAATCATCATCTGATATTCTGGGA
TTTTCCACCTGCATCATGATTGGAGGCAATGGGCAGTGCTCCATGAACGATGTCAAGATACGTTGTTCTTGTATTTTAAA
AGGAGTTGATGCTAAATAG
AA seq
Len:593 aa

MASAIVPSLRLSPSLSDATSPSSPSSSGDDLGAIQETTGSWSTETLISPLLFTLDHHPEGYHGLIKQEVFSITSKSTVQK
LFTLLELYCRESIGRYIRGAPLVDKADANLDSDESISALTIALVSSGPSLRARFVGQGYKHVCGRADMWYLRFQLILKVH
LILASTVDKKKVKKWKEALTILAAISGEDSRNWRDESKLIKKIVKDISDKLVFTSLDDSKGLIGMSSHMDFLQSMMSIED
EDVRMVGIWGMGGVGKTTIAKYLYSGLSCRFQAHCFIENVKEVYNRYGVRHFTRRVSMQNVWRAFEGLSNLKLLNFYDLA
YNGETRMHLPDGLSYLPRKLRSLHWDGYPLKSMPSRFHPEFLVEFCMSNSHLQKLWNGVQSFPPEICQTMRCLRWLDLEG
TGIKELPENNGNLIALKVLQARRTAIRRAPRSIALLTRLQVLAIGDSFYVSEGLHSLCPRLSSFDDLRVLCLSNMNMTEI
PNSIGDLWSLSELDLSASNCYKLDQEAQSLIHRNVQLDSARPEHLYFPGRDVPSCFSHQTMGPSLRIHVPQSQSSSDILG
FSTCIMIGGNGQCSMNDVKIRCSCILKGVDAK*
Expression(FPKM)
Classification(Core/Distributed)
Function classfication (GO)
Pfam
KEGG